François Coli

Point sur le risque constitué par le mutant E Coli O104:H4 producteurs de shigatoxine Les bactéries du genre Escherichia coli (E coli ou anciennement colibacille) sont classiquement des indicateurs d’hygiène et de contamination fécale récente. Elles font parties des Entérobactéries, qui, comme leur nom l’indique, vivent dans l’intestin des mammifères. Chez l’homme ces bactéries sont en général non pathogènes mais, à l’occasion de mutations ou d’acquisition de gènes, elles peuvent devenir responsables

rechercher systématiquement sont Salmonella, Shigella, Campylobacter (et Yersinia dans les pays industrialisés). Vibrio cholerae est le plus souvent recherché dans un contexte clinique particulier ou sur une demande spécifique. Les Escherichia coli pathogènes ne peuvent actuellement être totalement identifiés que dans des centres spécialisés (Instituts Pasteur). Clostridium difficile est recherché dans les diarrhées aiguës consécutives à une antibiothérapie importante. 1. Prélèvement -

vivants microcopiques Uniquement visible qu’au microscope Premiers êtres vivants sur terre Environ 3 à 4 miliards d’années Cours IFSI 2010 S1 Pr G. Arlet Evolution en millions d’année 4500 3000 2000 1000 0 Archaebactéries Cellule eucaryote 9 E. coli 0,03 Cours IFSI 2010 S1 Pr G. Arlet Classification des microbes • Etres unicellulaires : protistes • La division cellulaire génère deux individus • Protistes eucaryotes (vrai noyau) – Protozoaire – Algues – Champignons et levures • Protistes

1973, lorsqu’un gène d’un amphibien africain est inséré dans l’ADN d’une bactérie (2). En 1978, un gène humain codant pour l’insuline est introduit dans la bactérie Escherichia coli, afin que cette dernière produise l’insuline humaine. En 1983, le Canada autorise la production commerciale d’insuline à partir de l’E. coli GM. Aujourd'hui, cette insuline est utilisée dans le traitement du diabète. Les années 80 : le développement d’une technique d’insertion chez les végétaux C’est dans les années

urgente. Detection : Bacille G- , incurvé, mobile , NE , B- Ox+ , Aaf, fermentatif, indentifiable sur API E. Culture sur GO, drigalski, Saccharose+ sur TCBS . 2 sérotypage E.Coli : Mo de la flore commensale dans les selles. Mo pathovar :- E. coli ET (enterotox) - ECEH (entero-hémorragique ) Adhère à la muqueuse et sécrète d’autre type de toxine , les Shiga toxine qui inhibe la synthèse protéique ( cytotoxine ) , elles diffusent dans l’organismes et peuvent déclencher le syndrome hémolytique

alimentaire Certaines toxi-infections alimentaires entraînent des séquelles à long terme, avec des conséquences graves sur la santé et une incidence économique considérable, telles que : Le syndrome hémolytique-urémique et les arthropathies causés par E. coli (EPEC&EHEC). La cholécystite, la colite, l’endocardite, la méningite, la myocardite, l’ostéomyélite, la pancréatite, le syndrome rhumatoïde et la septicémie qui peuvent faire suite à une salmonellose. Pour évaluer cela, des analyses microbiologiques

en italique) - ex : Staphylococcus aureus ; Escherichia coli ; Streptocoque pyogenes • Nom commun ou d’usage courant (françcais lié à des caractères bactériologiques ou à la maladie) - Ex : Staphylocoque doré (S.aureus) ; Colibacille (E.coli) ; Streptocoque beta-hémolytique du groupe A (S.pyogenes) Nomenclatures bactériennes et classification (2) • Famille = regroupe plusieurs genres proches • Exemples : • Entérobactéries : E. coli, Salmonella… • Streptocoques : Staphylocoque doré, S. pneumoniae…

règne/domaine/Phylum/classe/ordre/famille/genre/espèce  3- Pour E.coli : - règne: Procaryotae- domaine: Bacteria- phylum : Proteobacteria- classe: Gammaproteobacteria - ordre: Enterobacteriales - famille: Enterobacteriaceae  - genre: Escherichia   - espèce : Escherichia coli | | | 4- La classification des bactéries entre elles repose sur plusieurs types d'observations et d'études. Les bactéries peuvent ainsi être classées et donc identifiées en fonction :  -de leur morphologie microscopique (bactérie de type

du consommateur ? C'est le rôle des inspecteurs de la DGCCRS et leur outil préféré est le thermomètre ! Second exemple de commentaire argumenté Depuis quelques jours en Allemagne, une nouvelle « attaque » de bactéries pathogènes de type E. coli sévit, entraînant de nombreux décès. Les individus ont probablement été contaminés par des aliments sur lesquels cette bactérie pathogène s'est multipliée. Leur ingestion provoque des symptômes similaires mais plus violents de la gastro-entérite

opaque, de diamètre ≥ 30mm, centrée au point d’inoculation Culture blanchâtre, opaque, de diamètre ≥ 30mm, centrée au point d’inoculation Migration culturale inhibée Salmonella Typhimurium Salmonella Typhimurium + Escherichia coli + Pseudomonas aeruginosa Escherichia coli Enterococcus faecalis ATCC 29212 Migration culturale inhibée STOCKAGE / CONSERVATION Milieu déshydraté : 2-25°C. - La date de péremption est mentionnée sur l’étiquette. - Milieu préparé en boîtes : 15 jours à 2-8°C