Intron

de l'enchaînement exon-intron dans un gène du génome, ici représenté par un chromosome.Un intron est une portion de gène non codante. Chez les organismes eucaryotes, les gènes qui codent les protéines sont constitués d'une suite d'exons et d'introns (comme dans intrusif) alternés. Par exemple : Exon1 - Intron1 - Exon2 - Intron2 - Exon3 - ... Après la transcription, l'ARN synthétisé va subir un certain nombre de modifications, dont l'épissage, au cours duquel les introns vont être excisés de l'ARN

exprimées (transcrits, ou ARNm). L’ ADNc ou ADN complémentaire exon intron ADN génomique, double brin In vivo …GAAATAAGCTGTTCTCTGCTTCAT… Brin codant …CTTTATTCGACAAGAGACGAAGTA… transcription ARN messager, simple brin (instable) …GAAAUUCUGCUUCAU… In vitro rétro-transcription …CTTTAAGACGAAGTA… ADNc, simple brin (stable) L’ADNc ne contient que les régions codantes d’un gène (élimination des introns) Fabrication des puces à ADN LE BUT: représenter sur la puce l’ensemble

est modifié afin de permettre l’accessibilité a à l’ADN e. Des régulateurs transcriptionnels modulent l’efficacité de la transcription 2. Élongation de la transcription a. Le gène possède un message fragmenté : exons et introns b. Processus identique aux procaryotes : un nucléotide à la fois en direction 5’→3’. Cette étape se fait dans le noyau c. Cette nouvelle molécule se nomme transcrit primaire(précurseur de l’ARNm ou pré-ARN) d. Ce transcrit

ARN messager. L’ARN pré-messager, après la transcription, subit un épissage (étape de l’expression de certaines gènes chez les eucaryotes, au cours de laquelle les introns de l’ARN pré-messager sont élimines et les exons lies les uns aux autres. L’ARN messager ainsi obtenu passe alors dans le cytoplasme où il est traduit). Les introns (portions de l’ARN pré-messager, ils représentent 90% de la séquence totale des gènes) sont éliminés. De plus, les exons, autre portions d’ARN, vont être liés les unes

protéine. La diversité des ARN messager produits à partir d'un gène s'explique par la nature de l'ARN messager la et par l’épissage qui est une modification post-transcriptionnelle En effet l'ARN pré- messager est constitués d'exons et d'introns. Les introns vont disparaitre est il va rester les exon qui vont se lier pour former l'ARN messager. En fonction des liaisons d'exons on en a différents types qui ont différents rôles.

part le remplacement de la Thymine par l’Uracile). Ce premier ARN est en fait constitué d’une alternance de tronçons qui ne serviront pas à la synthèse des protéines (= les introns) et de tronçons codant pour la chaine polypeptidique (= les exons). Il se produit ensuite, à l’intérieur du noyau une maturation de l’ARN : les introns sont supprimés et les exons successifs sont raccordés entre eux. Ce processus est appelé épissage. B- Un épissage différents selon le contexte cellulaire : Selon le

Cas de la chaîne de l’hémoglobine humaine L’hémoglobine est une protéine composée de 4 polypeptides : 2 chaînes et deux chaînes . La chaîne comprend 141 acides aminés. Voici la séquence de nucléotides codant pour le début du polypeptide (les introns sont grisés). N.B. Le brin codant est en bas A T G G T G G G A A A G A G A G T C A C C T G A C T C C A A T T T T A C C A C C C T T T C T C T C A G T G G A C T G A G G T T A A A T T C A A C G C T C C T G A G G A G A A G T C T G C C G T T A C T A A

forme d’un précurseur, ils subissent une maturation pour donner un ARNm actif. Cette maturation ce fait en partit au niveau du noyau. Pour les ARNm la maturation consiste en l’ajout d’une coiffe, une addition d’une queue poly A et en un épissage des introns/exons. 1 - Coiffe en 5’ Le coiffage de l’ARN implique une modification de l’extrémité 5’ du transcrit primaire. L’extrémité 5’ est coiffée par addition d’un nucléotide atypique. Dès la transcriptionil y a ajout d’une méthyl 7 guanosine

cela nous avons utilisé plusieurs logiciels permettant d'analyser cette séquence tels que Genscan, Augustus, BLAST, KEGG. I – Prédiction de gènes Dans un premier temps, on utilise les logiciels Genscan et Augustus pour caractériser la structure exon-intron du gène étudié. Genscan est un programme de détection de gènes ab initio c'est-à-dire qu'il n'utilise que la séquence ADN pour travailler, tandis que Augustus permet d'intégrer des données supplémentaires cependant on l'utilise comme un programme

différents : -300 gènes V : code pour la partie variable de l’anticorps, codé par un gène L juste avant -5 gènes J : gène de jonction -1 gène C : constant : code pour la partie constante des Ig. Entre ces gènes, fractions d’ADN qui sont des introns. Si il y a la séquence signal alors la protéine sera exploitée 2.L’ADN des LB La formation d’un gène fonctionnel pour la synthèse de la chaine légère kappa résulte de la recombinaison entre un gène V et un gène J. Cette recombinaison a lieu