Formamide

(cpm) de 32 P-amorce marquée inverse brin; réactions PCR ont été réalisées dans un Research PTC-200 thermocycleur MJ pour 25 cycles avec une température d'hybridation de 55 ° C. La moitié de chaque réaction de PCR a été mélangé à 1:1 avec 95% de formamide contenant 5% de tampon Tris 10 mM (pH 8,0) avec cyanol bleu de bromophénol et le xylène. RT-PCR ont été chargés sur 8% de polyacrylamide, 7,5 m gels d'urée et électrophorèse. Par la suite, les gels ont été séchés et imagés sur un Phosphorlmager Typhoon

synthétiques organiques Fibres de carbone et de graphite Fibres para-aramides (Kevlar®,Twaron®) Fibres polyoléfines Fluor Fluorotrichlorométhane Fluorure d'hydrogène (exprimée en F) Fluorure de carbonyle Fluorures (exprimée en F) Fonofos Formaldéhyde Formamide Formate d'éthyle Formate de méthyle Fréon® 11 Fréon® 112 Fréon® 113 Fréon® 114 Fréon® 115 Fréon® 12 Fréon® 12 B2 Fréon® 21 Fréon® 22 Fumées de soudage (non autrement classifiées) Furadan® Furfural [98-01-1] [944-22-9] [50-00-0] [75-12-7] [109-94-4]

molécule est longue, + le Tm sera élevé. - Le milieu de dénaturation: Tm augmente avec la présence dans le milieu de cations monovalents ou divalents; car les cations diminuent la répulsion des groupements phosphates. - Présence d'agents dénaturants (formamide) = compétiteur de liaisons hydrogènes - pH en milieu alcalin favorise la dénaturation 2.4 Hybridation Réaction qui conduit à l'appariement de 2 acides nucléiques simples brins d'origines différentes pour former une molécule d'ADN hybride (ou duplex)

existe des misappariements (mismatches) il faut soustraire de la Tm calculée autant de degrés C. que le pourcentage de séquence non-appariée de l’oligonucléotide. Lorsqu’on travaille en présence de formamide, il faut encore diminuer la Tm en fonction de la concentration de l’amide : T’m = Tm-0,6(% formamide) • 2006 - 2007 Biologie génique - Pr A. Raisonnier 117/183 Caractérisation des acides nucléiques 9.9 Southern blot BG 66 • Le Southern blot est une technique mise au point par

solution: thermodynamics of copolymer association.- Macromol. 1994; 27: 2414-2425. 69. YANG L. AND ALEXANDRIDIS P. Polyoxyalkylene block copolymers in formamide-water mixed solvents: micelle formation and structure studied by small angle neutron scattering. Langmuir. 2000; 16: 4819-4829. 70. ASWAL V. K., GOYAL P. S., KOHLBRECHER J. AND BAHADUR P.

à partir de l’hexaméthylènetétramine est +CH=NH. Par cette réaction, le toluène est converti en ortho et para-tolualdéhydes. Ce dernier est prépondérant. La réaction présente une para régiosélectivité. - Réaction de Vilsmeier ou Vilsmeier-Haack (formamide N,N-disubstitué + oxychlorure de phosphore) R O 1) (R')(R'')NCHO + POCl3 2) H2O Schéma 8.297 O R CHO La réaction de Vilsmeier ou Vilsmeier-Haack (1927) est sans doute la réaction la plus utilisée pour préparer des aldéhydes en positions

faisant sécher des gouttes de culture sur des lames de verre, jusqu'à obtenir une couche assez épaisse pour masquer le support sous-jacent. Les angles de contact θ sont alors déterminés par la méthode de la goutte posée, en utilisant de l'eau, du formamide et du 1-bromonaphtalène (Figure 21). Les mesures sont répétées 61 quatre fois sur deux exemplaires différents de chaque surface et sont réalisées à l'aide d'un polarimètre Krüss PT 100, à une température fixée à 25 °C. Figure 21. Angle

Eau de javel (voir Hypochlorite de sodium) Eau oxygénée (voir Peroxyde d’hydrogène) EDTA 112 Epichlorhydrine 114 Ethanol 116 Ethylène 118 Fluorure de phénylméthylsulfonyle (voir PMSF) Fluorure d’hydrogène (voir Acide fluorhydrique) Formaldéhyde 120 Formamide 122 Formol (voir Formaldéhyde) Glutaraldéhyde 124 Heptane 126 Hexane 128 Hydrazine 130 Hydrogène arsénié (voir Arsine) Hydroquinone 132 Hydroxyde d’ammonium (voir Ammoniaque) Hydroxyde de potassium 134 Hydroxyde de sodium 136 Hypochlorite de sodium

avec une solution de 40% méthanol et 7% acide acétique de 30 min. 2.6 Hybridation et transfert de type Northern L’ARN total a été extrait des parasites selon le protocole TRIzol (Invitrogen). 30 μg d’ARN ont été déposés sur un gel dénaturant de formamide et hybridés avec une sonde spécifique à eIF2α de L. major marquée au [α-32P]-dCTP. La préhybridation, l’hybridation ainsi que les lavages ont été effectués tels que décrits précédemment (Sambrook et al., 1989). 2.7 Immunobuvardage 50 μg d’extraits

2 8,6 8,9 8,1 7,6 9,2 6,8 7,2 δo 0 0 0 0 0 2 0 0 0 3 4 0 5 2,5 δa 1 0 0 0 0 2 0 0,5 0,5 0,5 3 0,5 2,5 4 δd 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 4 SOLVANT Pyridine Ethanol Acétonitrile Acide acétique Diméthylsulfox. Méthanol Ethanolamine Ethylène glycol Formamide Eau δ δp δo δa δd 10,4 11,2 11,8 12,4 12,8 12,9 13,5 14,7 17,9 21 9 6,8 6,5 7 8,4 6,2 8,5 8 8,3 6,3 4 4 8 5 0 5 5 2,5 0 7,5 5 G G G G 5 7,5 G G G G 0 7,5 G G G G - interactions de dispersion (forces de London) mesurées par δp. Les solvants