jBien que presque unanimement appréciés par l'Homme, les odontocètes sont confrontés à des menaces croissantes : * la pollution des océans et la contamination des réseaux trophiques à la tête desquelles ils se nourrissent. Avec les thons, les espadons, les cachalots ils sont les animaux marins qui contiennent le plus de métaux lourds, de dioxines et de résidus de pesticides. Leur chair qui est encore consommée au Japon présente des teneurs en métaux toxiques dépassant et souvent de beaucoup les normes internationales et nationales. Leur seule teneur en mercure suffirait théoriquement à en faire interdire la consommation dans la plupart des cas ; * la disparition d'une partie de leur nourriture à cause de la surexploitation des océans par l'Homme est une seconde menace ; * les blessures, les asphyxies ou le stress par captures accidentelles dans les chaluts ou filets maillants dérivants causent la mort de nombreux dauphins tous les ans ; * les cétacés se grattent parfois sur le fond sur des rochers ou des objets durs pour se nettoyer la peau ou débarrasser de parasites, on peut craindre qu'ils soient en contact de plus en plus fréquent avec des munitions immergées ou qu'ils soient intoxiqués par leur nourriture dans les zones où des munitions ou d'autres déchets ont été immergés ; * on évoque aussi depuis une dizaine d'année l'usage de plus en plus fréquent de sondeurs et sonars civils ou militaires ou d'explosions sous-marines à vocation de détection de ressources pétrolières par exemple qui pourraient affecter leur système auditif et d'écholocation, et peut-être expliquer certains échouages en séries ; * il se pourrait que la mondialisation des échanges diffuse aussi des microbes susceptibles d'affecter les cétacés, dont le virus de la grippe auquel ils sont sensibles.
Les odontocètes de Méditerranée sont atteints par une épidémie[9]. S'il est identifié une atteinte virale : Morbillivirus[10], cette épidémie atteint plus les jeunes. Or,