Ikedaya jinken
Les Ishin Shishi utilisaient Ikedaya comme base de leurs opérations. Leur plan était de mettre le feu à Kyōto et de capturer Matsudaira Katamori le daimyo d'Aizu dont les fonctions à l'époque incluaient la protection de Kyōto. Cependant, avant que les Ishin Shishi puissent mettre leur plan à exécution, le Shinsengumi arrêta un membre des Ishin Shishi qui, soumis à l'interrogation, dévoila leur plan. L'interrogation conduite par le vice-commandant du Shinsengumi, Hijikata Toshizo, aurait été particulièrement brutale. Voyant que le prisonnier était peu enclin à répondre aux questions, Hijikata Toshizo l'aurait suspendu par les chevilles et aurait enfoncé des clous dans ses pieds avant d'y répandre de la cire chaude.
Averti de l'urgence de la situation, le commandant du Shinsengumi, Kondo Isami, partit avec un groupe d'hommes afin d'arrêter les Ishin Shishi avant qu'ils ne puissent mettre leur plan à exécution. Un second groupe d'hommes menés par Hijikata Toshizo les rejoignit peu après à Ikedaya.
Cependant, certains rapports de l'incident mettent en doute les méthodes de torture utilisées par Hijikata Toshizo. En effet, dans ses mémoires, Nagakura Shinpachi décrit les évènements différemment et le populaire roman de Shiba Ryotaro, Moeyoken ignore totalement la participation d'Hijikata dans l'affaire.
Au total, huit membres des Ishin Shishi furent tués et vingt-trois furent arrêtés. Un seul membre du Shinsengumi fut tué sur le coup, mais deux moururent plus tard de leurs blessures. Les capitaines Nagakura Shinpachi et Todo Heisuke reçurent des blessures non-fatales. Une rumeur persistante veut qu'Sôji Okita, en raison de sa tuberculose cracha du sang sous l'effort et