Cours d'enzymologie fondamentale

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I.

Introduction à l'étude de l'enzymologie.

A. Vocabulaire. Substrat : structure qui sera susceptible d'être transformée lors d'une réaction chimique (A donne B) catalysée par un enzyme pour donner un produit B. Le substrat pourra aussi être un produit. Produit : il est issu de la transformation par une enzyme. Le produit peut être un substrat pour une autre enzyme. Inhibiteur : composé reconnu par l'enzyme mais ne conduisant pas à une réaction. Effecteur : composé chimique qui va modifier la réaction catalysée par une enzyme. Il va modifier le comportement cinétique de la réaction. Ce composé ne sera pas transformé lors de la réaction. Comme effecteur, il y a le Mg2+ qui, associé à la β galactosidase, va conduire à une vitesse initiale de réaction plus grande. Ligand / antiligand : Les ligands sont des composés qui vont se fixer sur les antiligands pour former un complexe ligand / antiligand. Forme enzymatique : C'est une (ou plusieurs) conformation (forme, configuration spatiale) que va prendre la l'enzyme au cours de la réaction qu'elle catalyse. Turn over number : C'est une fréquence (t-1). B. Introduction. Une enzyme sert à accélérer une réaction chimique au niveau biologique (métabolisme cellulaire). Il existe environ 3000 enzymes différentes, alors que la quantité d'anticorps est quasi infinie. L'enzyme peut avoir plusieurs activités différentes (au moins 3000). Les enzymes sont beaucoup plus spécifiques que les catalyseurs chimiques. Toutes les enzymes sont des protéines mais il est possible d'avoir une activité enzymatique avec autre chose que des protéines. Ce sont de grosses protéines ayant un poids moléculaire compris entre 12.103 à 106 Da. Les enzymes ont aussi un rôle de coordinateurs. Elles vont avoir des sites actifs et des sites capable de fixer les ligands. Elles sont rarement activées directement. Elles utilisent plutôt un méchanisme d'activation qui va comprendre une cascade de réactions appelée