Chapitre II : Les acides aminés protéiques

Les différents acides aminés : (Mm moyenne = 110Da)  Les acides aminés hydrophobes :

Glycine : Gly, G Alanine : Ala, A Valine: Val, V Leucine : Leu, L Isoleucine : Ile, I

 Les acides aminés alcooliques :

Sérine : Ser, S Thréonine : Thr, T

 Les acides aminés acides : Asx : B / Glx : Z

Glutamate : Glu, E Aspartate : Asp, D Glutamine : Gln, Q Asparagine : Asn, N

 Les acides aminés basiques :

Arginine : Arg, R Lysine : Lys, K Histidine : His, H

Noyau guanidinium Noyau imidazole  Les acides aminés aromatique :

Phénylalanine : Phe, F Tyrosine : Tyr, Y Tryptophane : Trp, W

 Les acides aminés soufrés :

Méthionine : Met, M Cystéine : Cys, C

 L’iminoacide :

Proline : Pro, P

Quelques acides aminés particuliers :

Histamine Dopamine Ornithine Citrulline

La stéréochimie :

Chaque acide aminé possède au moins un carbone asymétrique (sauf la thréonine et l’isoleucine qui en ont deux et la glycine qui n’en possède pas).
Chaque acide aminé est classé dans le système R/S : tous les acides aminés sont de la série S, sauf la cystéine qui est de la série R. Cas particulier : 2S 3R T et 2S 3S I

Isomère L : (dans les protéines)

Isomère D :

Chaque acide aminé dévie le plan de polarisation : de façon lévogyre (à gauche) et de façon dextrogyre (à droite).

Les propriétés physico-chimiques :

Les propriétés ioniques :

Chaque acide aminé libre possède au moins deux groupements fonctionnels et peut posséder d’autres fonctions sur les chaînes latérales (R).

pK= 2-3 pK= 9-10

Les acides aminés portant des groupements fonctionnels sur les chaînes latérales possèdent