Biochimie Structurale ENZYMES CO ENZYMES 2007 2008
UNIVERSITE DE RENNES I
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FACULTE DE MEDECINE
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DEPARTEMENT DE BIOCHIMIE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE
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PCEM 1
Biochimie Structurale
ENZYMES
CO-ENZYMES
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Pr Marc Denis
Année Universitaire 2007-2008
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ENZYMOLOGIE
1. GENERALITES
1.1. Définitions
1.1.1. Enzyme
1.1.2. Substrat – Produit
1.1.3. Site actif
1.2. Mode d’action
Diagramme d'une réaction catalytique qui montre l'énergie (E) requise à différentes étapes suivant l'axe du temps (t).
1.3. Caractéristiques
CH 2 OH
O
O
β
R
+ H2O
β Galactosidase
β D Galactoside
2. CLASSIFICATION DES ENZYMES
2.1. Oxydo-réductases – EC1
2.2. Transférases – EC2
2.3. Hydrolases – EC3
2.4. Lyases – EC4
2.5. Isomérases – EC5
2.6. Ligases (ou synthétases) – EC6
CH 2OH
O OH
+ R
β D Galactose
OH
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3. CINETIQUE DES REACTIONS ENZYMATIQUES A UN SUBSTRAT MODELE DE MICHAELIS
3.1. Généralités
3.1.1. Influence de la concentration en enzyme v v2 v1 E1
E2
[E]
Concentrations
3.1.2. Influence de la concentration en substrat
a) Variation de [S], [P] et [ES] au cours du temps
S
P
ES
0
tA
tB
b) Variation de la vitesse en fonction de [S]
v
VM
Enzyme saturé
[S]
COURBE DE SATURATION
Temps
4/22
3.2 . Aspect théorique – Equation de Michaelis
v=
VM [S ]
[S ] + KM
3.3. Signification des paramètres cinétiques
3.3.1 Constante de Michaelis KM
ENZYME
SUBSTRAT
Glucose phosphate isomérase
Aldolase
Triose phosphate isomérase
Glucose-6-phosphate
Fructose1,6-diphosphate
Glycéraldéhyde-3phosphate
Glycéraldéhyde-3phosphate
3-Phosphoglycérate
Glycéraldéhyde-3-phosphate deshydrogénase Phosphoglycérate kinase
CONCENTRATION
(µM)
450
32
3
KM
(µM)
700
100
460
3
70
60
1200
3.3.2 Vitesse maximale VM
3.4. Détermination des paramètres cinétiques
1
1 KM 1
=
+ v VM [S ] VM
Représentation de Lineweaver et Burk
5/22
3.5. Activité enzymatique
3.5.1. Définitions et unités
3.5.2. Activité spécifique
4. EFFECTEURS DE L'ACTIVITE ENZYMATIQUE
Activité enzymatique
4.1. Influence de la